Штамм омикрон: Don’t Panic!

Елена Клещенко
Елена Клещенко

Ситуация со штаммом омикрон коронавируса SARS-CoV-2 пока напоминает старый черный анекдот про человека, упавшего в яму, и его товарища: «Ты как там, жив?!» — «Жив!» — «Ничего не сломал?!» — «Нет!» — «Хорошо! А куда упал?» — «Да еще лечу!» Все спрашивают экспертов, что будет, насколько тяжелый ковид вызывает омикрон, как быстро он распространяется и обойдет ли вакцинный иммунитет, и эксперты отвечают: надо набраться терпения, для получения надежных данных необходимо время.

Время нужно для наблюдения за больными. Эта история началась буквально только что. Самые ранние известные образцы, по-видимому, были получены в первую декаду ноября (хотя ясно, что вирус распространялся в популяции и раньше). Первый геном нового варианта загрузили в базу GISAID из Гонконга 22 ноября; тот факт, что из Гонконга, говорит нам, что ставить военные кордоны вокруг стран Южной Африки вряд ли имело смысл. Потом еще 10 геномов из Ботсваны и ЮАР загрузили 23 ноября; 24 ноября он получил обозначение B.1.1.529; 25 ноября Министерство здравоохранения ЮАР опубликовало для СМИ краткую информацию об этом варианте, 26 ноября Всемирная организация здравоохранения классифицировала его как VOC, присвоив ему название «омикрон».

Четвертого декабря ВОЗ сообщила [1], что пока нет данных о летальных исходах, вызванных омикроном. Появились уже теории о том, что омикрон — друг человека, этакая естественная вакцина, которая всех заразит, но никого не убьет, и коронавирус наконец-то станет тем, чем его считали оптимисты весной 2020 года: просто еще одним респираторным заболеванием.

Однако рост числа случаев в Южно-Африканской Республике начался около 23 ноября, а все мы, к сожалению, знаем, что волна летальных исходов отстает по времени от волны новых случаев: COVID-19, если убивает, убивает не мгновенно. Кроме того, население африканских стран моложе населения Европы, США или Японии, и путешественники в Африку, как правило, люди относительно молодые и здоровые, а основная часть смертей от COVID-19 приходится на пожилой возраст.

Были тревожные сообщения о повышенной заболеваемости младших возрастных групп, в том числе маленьких детей, в регионах, где распространился омикрон. Но пока неясно, как это следует интерпретировать: резкое увеличение числа госпитализаций в детских больницах в ЮАР было и во время дельта-волны [2]. Появились сообщения о росте общего числа госпитализаций и о некоторых тяжелых случаях [3].

Для кого-то это прозвучит цинично, но необходимо подождать, когда у нас будет достаточно данных о случаях COVID-19, тяжести протекания и летальных исходах в различных группах населения: старых и молодых, переболевших, иммунизированных различными вакцинами и неиммунных.

В геноме омикрона огромное число мутаций — рекордное даже по сравнению с другими штаммами, вызывающими опасения [4]. Есть мнение, что этот вирус эволюционировал в организме иммунодефицитного человека, который долго не мог выздороветь от COVID-19 — такие случаи описаны. Особенно много изменений в S-белке (он же спайк или шип), который отвечает за связывание коронавируса с клеткой. Именно с этим белком связываются и нейтрализующие антитела, которые коронавирус в клетку не пускают.

Среди этих мутаций много таких, которые уже известны с плохой стороны. Некоторые присутствуют в других штаммах и делают их более опасными. Другие, по данным матмоделирования, которое провели еще летом Фэн Чжан, Юрий Вульф и Евгений Кунин с соавторами, ослабляют связывание с антителами против старых штаммов коронавируса и при этом не влияют на его связывание с клеткой [5].

Сейчас многие вспоминают сентябрьскую публикацию в Nature — опыты, в которых плазмой крови переболевших и вакцинированных пытались нейтрализовать синтетический псевдовирус [6]. Это обычная практика при изучении иммунного ответа на коронавирус: получают безопасные вирусы, несущие S-белок коронавируса, которые могут заражать только клетки в культуре. В таком эксперименте удобно смотреть, как заражению препятствуют антитела человека. Так вот, авторы создали псевдовирус-полимутант — с 20 мутациями, вызывающими замены аминокислот в S-белке, — и антитела вакцинированных людей перестали нейтрализовать этот псевдовирус. (Правда, антитела переболевших и затем вакцинированных справлялись неплохо.)

В спайке омикрона более 30 мутаций, и это не сулит ничего хорошего; есть важные мутации и в других белках. Кроме мутаций, обеспечивающих уклонение от антител, отмечены такие, которые помогают вирусу легче проникать в клетку, уклоняться от врожденного иммунитета (то есть делают его более заразным). Выглядит геном на редкость неприятно. Идея отмены авиаперелетов на основании ТАКИХ биоинформатических данных не кажется алармистской.

И в самом деле, есть сообщения о полностью вакцинированных людях, которые тем не менее уже заразились омикроном. Можно ожидать, что они будут легче переносить болезнь, но сам факт не радует. В эти выходные все обсуждают первый препринт из ЮАР, авторы которого оценили риск повторной инфекции в ноябре 2021 года по сравнению с первой, второй (бета) и третьей (дельта) волной в ЮАР [7]. К их результатам могут возникнуть вопросы — например, удивительно, что авторы не выявили у беты и дельты повышенной способности уклоняться от иммунного ответа, но у омикрона такая способность точно имеется, и более выраженная, чем у предыдущих штаммов.

Насколько хорошо омикрон ускользает от антител, тоже можно исследовать в лабораторных условиях, на псевдовирусах, и это уже делается. Но такие эксперименты занимают несколько недель.

Европейский центр профилактики и контроля заболеваний (ECDC) оценил общий уровень риска для стран Евросоюза и Европейской экономической зоны, связанный с дальнейшим появлением и распространением омикрона, «от высокого до очень высокого» [8]. По очень приблизительным оценкам, через 1–5 месяцев омикрон может стать причиной более половины новых случаев коронавирусной инфекции в Европе. (Точные сроки зависят от того, сколько случаев вызывается омикроном в Европе сейчас, от того, насколько он на самом деле заразен и как быстро распространяется.)

Что можно делать пока? То же, что и до омикрона: носить маски в общественных местах, прививаться (как защищены привитые, предстоит определить, но непривитым омикрон точно не обещает ничего хорошего) и не жалеть средств на эпидемиологические наблюдения. Россия далеко не чемпион по секвенированию геномов коронавируса среди стран мира [9]. Поэтому не исключено, что омикрон уже здесь, просто мы об этом не знаем. У двух наших путешественников, которые вернулись из ЮАР и находились на карантине, омикрон обнаружили [10]. Ведущие производители вакцин всерьез задумались о версии 2.0 и о том, как сделать ее быстрее [11]. Такие планы есть и у разработчиков «Спутника» [12]. Похоже, имеется как минимум одно эффективное лекарство в таблетированной форме — «Паксловид» от Pfizer, который проходит клинические испытания в том числе и в РФ [13, 14].

А мы воспользуемся универсальным советом из «Автостопом по Галактике» Дугласа Адамса для любой тревожной ситуации с высокой степенью непонятности: Don’t Panic (без паники)! Коронавирусная пандемия — испытание для психики, все мы устали болеть, бояться за близких и ждать плохих новостей. Но мы пережили первую волну, когда не было ни вакцин, ни лекарств, ни уверенности в том, что они появятся. Справимся и с омикроном. Наверняка уже на момент, когда этот номер выйдет из печати, мы будем знать больше.

Елена Клещенко

1. theguardian.com/world/2021/dec/04/who-says-no-deaths-reported-from-omicron-yet-as-covid-variant-spreads

2. cbsnews.com/news/omicron-variant-children-south-africa/

3. cnbc.com/2021/12/01/covid-who-says-south-africa-hospitalizations-rising-omicron-severity-unclear.html

4. covariants.org/shared-mutations

5. pcr.news/novosti/koronavirus-ne-mozhet-beskonechno-uvelichivat-svoyu-prisposoblennost/

6. nature.com/articles/s41586–021–04005–0

7. medrxiv.org/content/10.1101/2021.11.11.21266068v2

8. ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-threat-assessment-spread-omicron-first-update

9. pcr.news/novosti/md-2021-den-2-molekulyarnaya-diagnostika-covid-19-/

10. kommersant.ru/doc/5113010

11. nytimes.com/2021/11/28/health/covid-omicron-vaccines-immunity.html

12. tass.ru/obschestvo/13099423

13. pcr.news/stati/tabletka-ot-koronavirusa-kompanii-pfizer-proydet-klinicheskie-issledovaniya-v-rossii/

14. clinline.ru/reestr-klinicheskih-issledovanij/738–12.11.2021.html

Если вы нашли ошибку, пожалуйста, выделите фрагмент текста и нажмите Ctrl+Enter.

См. также:

Подписаться
Уведомление о
guest
61 Комментария(-ев)
Встроенные отзывы
Посмотреть все комментарии
Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад

Товарищ Сахин из Бионтеха уже пообещал вакцину от Омикрона к марту.
Естественно, вакцина будет колоться три раза.
А как вы думали?
https://www.youtube.com/watch?v=Lye1DqU5fwg

Loki
Loki
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

И самое интересное в этом ролике- вот должна колоться три раза и все. Почему? Да вот так мы сказали)) Хорошо еще should а не have to)

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

https://www.mk.ru/social/2021/12/10/rossiyskie-virusologi-vystupili-protiv-evropeyskikh-planov-revakcinacii-kazhdye-tri-mesyaca.html
«Нам не нужно мордовать население…»!
Уже, стало быть достаточно / м.б. даже вусмерть замордовали типа?! (ритор вопр)
Л.К.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад

Medicago and GSK создали вакцину на основе растений. В картошке вырастают частицы вируса. Утверждают, эффективность 75-90%.https://www.gsk.com/en-gb/media/press-releases/medicago-and-gsk-announce-positive-phase-3-efficacy-and-safety-results/

Loki
Loki
1 месяц назад

В статье призывают Don’t Panic! А что, у кого-то думающего была паника раньше? Хорошо поставленная паника только в биг СМИ.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад

https://www.rbc.ru/rbcfreenews/61b35eb29a7947c96fe4f728?from=newsfeed

интересно, откуда видео. надеюсь, что не из России.
шприцы колют без аспирации. просто втыкает и давит на поршень.
результат может быть очень плачевный

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

https://www.fondsk.ru/news/2021/08/05/mirovye-medicinskie-avtoritety-i-mirovaja-inkvizicia-54178.html
Старый (относительно быстротекущего времени), подзабытый источник.
Л.К.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов
Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов
Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

https://zen.yandex.ru/media/tsargrad.tv/golikova-i-popova-figuranty-rassledovaniia-61b1e0a2ea142348fe8c0413?&
Алаверды!
Насколько основательно (при сомнительности и неперепроверенности источника)?
Как сие понимать?
И как к подобному следует относиться?
Л.К.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов

«Председатель Госдумы отреагировал на эти слова. Обращаясь к вице-спикеру Александру Жукову, Вячеслав Володин сказал:

Прошу изучить информацию, которую озвучил Коломейцев, и затем проинформировать депутатов.»

Да ну! А раньше он не знал?
Ничего реально они делать не будут.
Как говорится, не надо кидаться камнями, когда сам сидишь в стеклянном доме.

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч
Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад

https://tass.ru/obschestvo/13175807
Считаю QR — коды страшным злом, способствующим распространению разных штаммов ковида.
Л.К.

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов
Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад

На сей раз текст госп. Клещенко, имхо, спокоен и информативен (даже анекдот вначале не портит, как мне показалось — Л.К.).
К тому же внушает некоторый оптимизм ссылка 5 на содержательный, имхо, русскоязычный текст:
https://pcr.news/novosti/koronavirus-ne-mozhet-beskonechno-uvelichivat-svoyu-prisposoblennost/
требующий перепроверок с дальнейшими обоснованиями / возможными контраргументами «по мере поступления» новых знаний.
Как говорит один из моих уважаемых визави, «запасёмся попкорном» и зря трепыхаться не будем, типа от малейшего фейкошороха. Это уж точно!
Спасибо госпоже Клещенко за разумный и, главное, выдержанный в спокойных тонах содержательный текст. От пишущего эти строки.
Л.К.

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад

https://iz.ru/1262828/2021-12-13/v-ssha-opublikovali-rezultaty-tretei-fazy-issledovanii-koronavira
Насколько основательно? По всей видимости, имхо, — вполне.
Л.К.

Последняя редакция 1 месяц назад от Леонид Коганов
Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов
Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад

в южной корее полностью привиты 81% всего населения. 13% получили бустер.
результат видим:
рекордная волна заражений, здравоохранение в коллапсе.
5-7 тысяч заболевших ежедневно, сегодня 94 умерших.
распространяются 4 варианта Дельты
AY.4.2, AY.25.2, AY.104 и ещё один совсем новый, который пока ещё не классифицирован.
прививки явно стимулируют разнообразие вируса.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад

В Великобритании доктор Пол Бертон, главный врач Moderna, разговаривал с депутатами Комитета по науке и технологиям Общинного сообщества.

Бертон сказал, что он ожидает данных в ближайшие дни, чтобы показать, насколько хорошо бустер Moderna улучшает защиту от варианта Omicron.

Он предостерег от заявлений, в основном из Южной Африки, что этот вариант вызывает более легкое заболевание, и предупредил, что Омикрон и Дельта, вероятно, будут циркулировать вместе в течение некоторого времени.

«Я не думаю, что Omicron является более мягкой и менее опасной версией текущего вируса», — сказал он комитету.

Добавил он:

Идея, что он вытеснит Delta с дороги и захватит власть, может возникнуть в будущем, но я думаю, что в ближайшие месяцы эти два вируса будут сосуществовать, и Omicron, который, как я считаю, на самом деле является серьезным заболеванием, будет теперь заражают людей на фоне очень и очень сильного давления Дельты.

Это также приведет к ситуации, когда люди станут ко-инфицированными … что дает этому вирусу возможность дальнейшего развития и мутации, что вызывает беспокойство и вызывает беспокойство.

Нам, конечно, не нужно паниковать, в нашем распоряжении много разных инструментов, мы так много узнали об этом вирусе за последние два года, и мы можем продолжать бороться с ним, но я думаю, что Omicron представляет реальную угрозу.

Если посмотреть на данные в SA, то около 15% госпитализированных людей находятся в отделениях интенсивной терапии, и, хотя есть различия, если вы оглянетесь назад в прошлом году, во время всплеска дельты в августе, эти цифры примерно то же 15%.

Так что, хотя уровень смертности, который мы наблюдаем прямо сейчас, к счастью, ниже, я думаю, что как болезнь это очень подходящий вирус, и он серьезен.

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад

Это бомба!
Или у него крышу снесло?
https://www.rbc.ru/society/15/12/2021/61b9ae169a79470750350c2f

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

Вполне допустимо.
Почему, если, к примеру в стиле Фаучи — Дашека (транскрипция по статье Латыниной «Побег из Уханя» в Нов Газ) можно «усиливать функции» (допустим, патогенности), то с другой стороны, реверсивно, почему нельзя искусственным путём «ослаблять (напротив — эти же самые растреклятые) функции»)?
Чай, не второе начало термодинамики — динамической теории тепла по Клаузиусу и Кельвину.
Вынул / вставил-добавил, и вся, как говорится, недолга.
Что мешает принять подобную точку зрения, какие принципиальные препятствия?
Л.К.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов

Мнение Сергеева я очень уважаю:
https://lenta.ru/news/2021/12/17/omikronmutant/

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

Насколько мне известно, президент РАН господин Сергеев по профессии есть физик — экспериментатор, а отнюдь не профессиональный биолог.
Внутри самой РАН, похоже, единого мнения нет (в биологическом и медицинском отделениях).
Вы имеете , разумеется, полное право уважать личное мнение господина Сергеева, равно как и любого другого лица. Однако, смею заметить, здесь его компетентность ограничена и весьма, имхо.
Л.К.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов

Я прекрасно знаю Александра Михайловича и знаю, что порожняк нести он не будет.
Он президент РАН. Только что было общее собрание посвященное эпидемии. Видимо, это информация из кулуаров.

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч
Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

https://lenta.ru/news/2021/12/19/wuhan/
Практически во всех значимых источниках.
Л.К.

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов
Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов

Этот вирус поумнее всех академиков вместе взятых. Но они добалуются.

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

Бог, возможно, простит их (и не только).
Но лишь в том случае, если перестанут лгать и заниматься пуганью — перестанут пригибать / нагибать по указке и без оной простых людей.
Так думаю.
Л.К.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов

https://poll.britishhealthalliance.com/vaccine-passports/
у бритов можно проголосовать за/против введения ковидных паспортов.
смысла никакого, но каждый может сказать своё фе.
каждый!

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

Смысл — в свободе выражения разных, порой, разнонаправленных мнений.
Л.К.
Вам, простите, — мало?
Мне в Перестройку хватило, чтоб прожить и опубликовать монографию.
Вообще-то научники обязаны по статусу ратовать за / поддерживать всеми фибрами свободу мнений и выражений оных. Иначе — сваливание в лысенкоизм = какой-либо вид научного тоталитаризма — неизбежно. Имхо.
К.

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад

https://www.mk.ru/social/2021/12/14/pervaya-smert-ot-koronavirusa-omikron-vyzvala-somneniya-uchenykhа.html
Как понимать?
Л.К.
Про вынужденную (подчёркиваю! — Л.К.) необходимость бустеров исключительно для уже привитых писано неоднократно, в том числе и в комментах к соответствующим по тематике страницам ТрВ (в виду резкого падения титра антител за весьма, имхо, сравнительно недолгий временной период).
К.

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов

да туфта какая-то это омикрон.
в южной африке не только никто не умер от этого омикрона, но и никого ещё не госпитализировали из-за него.
все, кто с омикроном в госпитале — попали туда по другой причине (например, перелом), а омикрон у них нашли уже при тестировании.

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

https://www.mk.ru/social/health/2021/12/16/shtamm-omikron-obnaruzhili-eshhe-v-iyune-no-togda-promolchali.html
Как понимать? Особенно последние фразы.
Л.К.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов
Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

Не понял (пафоса, возможно? — Л.К.) по необразованности. Прошу об’яснений на популярном уровне: в чём, собственно заключается по образному выражению «хреноватость» (типа).
Заранее признателен.
Л.К.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов

В базе данных записано:

Earliest sample date2021-11-15

Я бы верил этой дате. Мы видим, как быстро он распространяется. Если бы он появился раньше, уже вся планета бы чихала.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmed.2021.798095/full
Описание случая: сверхбыстрое развитие рака после мРНК укола.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

Может статься, и не одна типа?!:
https://www.osnmedia.ru/world/finskie-uchenye-vyyasnili-chto-sposobno-snizit-risk-zarazheniya-covid-na-90/
Это, разумеется, «из другой оперы», но как оно Вам, а? То, что в конце текста.
Л.К.
Прошу не считать рекламой ничего и никого.
К.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов
Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч
Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад

наш любимый омикрон уже дал потомство
https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/367

145681747-318eb887-eea0-45f8-bc4e-f0d4ea65e5d7.png
Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад
В ответ на:  Леонид Коганов

https://www.vedomosti.ru/society/articles/2021/11/29/898151-umershih-antirekord
вымираемс
не обязательно от короны
плодиться надо!

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад

https://polit.ru/news/2021/12/19/durachki/
Останутся в…ну, конечно, в них самИх!
Л.К

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад

https://www.youtube.com/watch?v=cbPmGE5QQtE
Premier League icon Matt Le Tissier требует расследования, от чего погибли сотни профессиональных спортсменов в году 2021.
я думаю, его «отменят».

Леонид Коганов
Леонид Коганов
1 месяц назад
В ответ на:  Пал Палыч

https://zen.yandex.ru/media/finnews_rus/effektivnost-vakcin-protiv-novogo-shtamma-omikron-nahoditsia-pod-voprosom-no-voz-nastaivaet-na-prodoljenii-vakcinacii-61a5575d05bcdb7b6dbfca20?&
Л.К.
Интересен стиль указа датированного сегодняшним 20 числом за подписью министра здравоохранения РФ господина Мурашко. Особенно о так называемых «городах — миллионниках».
К.

Пал Палыч
Пал Палыч
1 месяц назад

мдя. спутник против омикрона совсем не боец
https://www.9tv.co.il/item/37675

Alex
Alex
1 месяц назад

«мы пережили первую волну, когда не было ни вакцин, ни лекарств, ни уверенности в том, что они появятся. Справимся и с омикроном»

Пережить и справиться — не одно и то же.

Оценить: 
Звёзд: 1Звёзд: 2Звёзд: 3Звёзд: 4Звёзд: 5 (2 оценок, среднее: 4,50 из 5)
Загрузка...
 
 

Сообщить об опечатке

Текст, который будет отправлен нашим редакторам: