Тибетский денисовец

Фрагмент челюсти денисовца с несколькими зубами, найденный в 1980 году буддистским монахом в карстовой пещере Байшия. sciencedaily.com
Фрагмент челюсти денисовца с несколькими зубами, найденный в 1980 году буддистским монахом в карстовой пещере Байшия. sciencedaily.com

Это должно было рано или поздно произойти, и это произошло.

До сих пор мы знали денисовцев — представителей третьей ветви Homo sapiens (две другие — неандертальцы и кроманьонцы, т. е. мы) — только по небольшим косточкам из Денисовой пещеры на Алтае: зубы, фаланги пальцев. К счастью, этого было достаточно, чтобы определить геномную последовательность; собственно говоря, по геному и выделили денисовцев в отдельную группу [1].

Денисовцы жили в этой пещере на протяжении как минимум сотни тысяч лет, перемежаясь и скрещиваясь с неандертальцами. Сенсацией прошлого года стал геном девочки, мама которой была неандерталкой, а папа — денисовцем [2]. Но, с другой стороны, фрагменты денисовского происхождения обнаружены в геномах австранезийцев (до 5% в индивидуальных геномах), восточных и южных азиатов и американских индейцев, причем скрещивания происходили неоднократно [34]. Так, фрагменты от одной группы денисовцев были найдены только в геномах современных жителей Новой Гвинеи, причем по некоторым оценкам скрещивание случилось всего 15–30 тыс. лет назад (впрочем, эта датировка оспаривается) [5]. В любом случае это означает, что денисовцы жили не только на Алтае и в разных частях своего ареала встречались с предками современных людей, оставляя свой след в геномах многих этнических групп. Однако мы видели только эти следы и не видели самих денисовцев: костей нигде не было, хотя всё свидетельствует о том, что они должны обнаруживаться не только в Денисовой пещере.

Денисовские варианты некоторых генов оказались полезными для южных и восточных азиатов [6], инуитов Гренландии [7] и тибетцев. Практически у всех тибетцев имеется денисовский вариант гена EPAS1, полезный для жизни на большой высоте [8]; вообще, оказалось, что чем выше живет тибетец, тем больше у него в геноме денисовских и неандертальских фрагментов [9].

И, похоже, первыми жителями Тибетского плато как раз и были денисовцы [10]. Как уже бывало в исследованиях древней ДНК, археологическое открытие было сделано не на раскопках, а в музее. Кость — фрагмент челюсти с несколькими зубами — была найдена еще в 1980 году буддистским монахом в карстовой пещере Байшия и передана Шестому Живому Будде Гун-Тан, который, в свою очередь, отправил ее в университет Ланьчжоу [11]. Исследователи из этого университета Фаху Чэнь и Дунцзюй Чжан передали кость для исследования в Институт эволюционной антропологии Общества Макcа Планка, в котором и открыли денисовцев девять лет назад [1]. ДНК не сохранилась, однако удалось выделить и исследовать белки из дентина, твердой ткани зуба, — в них нашлись варианты, характерные именно для денисовцев, а известняковая корка дала возможность определить ее возраст, 160 тыс. лет, что совпадает с возрастом самых старых костей из Денисовой пещеры и что существенно раньше, чем выход из Африки предков современных евроазиатов.

Чего ждать? Можно надеяться на денисовские кости с сохранившейся ДНК, то ли в раскопках, коль скоро теперь стало ясно, где можно искать, то ли в музейных образцах. Но сенсацией были бы геномы новых ветвей гоминид. На то, что они могут найтись, намекают фрагменты, унаследованные от неизвестных гоминид, в геномах тибетцев [9], индийцев и жителей Андаманских островов [12, 13] (однако есть сомнения [14]), пигмеев Центральной и Южной Африки [15, 16], да и самих денисовцев [13].

Михаил Гельфанд

  1. Reich D, …, Pääbo S. Genetic history of an archaic hominin group from Denisova Cave in Siberia. Nature. 2010; 468(7327): 1053–60. doi: 10.1038/nature09710. ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4306417/
  2. Slon V, …, Pääbo S. The genome of the offspring of a Neanderthal mother and a Denisovan father. Nature. 2018; 561(7721): 113–116. doi: 10.1038/s41586–018–0455-x. ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6130845/
  3. Skov L, …, Durbin R. Detecting archaic introgression using an unadmixed outgroup. PLoS Genet. 2018; 14(9): e1007641. doi: 10.1371/journal.pgen.1007641. journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1007641
  4. Browning SR, Browning BL, Zhou Y, Tucci S, Akey JM. Analysis of Human Sequence Data Reveals Two Pulses of Archaic Denisovan Admixture. Cell. 2018; 173(1): 53–61.e9. doi: 10.1016/j.cell.2018.02.031. sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867418301752
  5. Gibbons A. Moderns said to mate with late-surviving Denisovans. Science. 2019; 364(6435): 12–13. doi: 10.1126/science.364.6435.12. sciencemag.org/news/2019/03/our-mysterious-cousins-denisovans-may-have-mated-modern-humans-recently-15000-years-ago
  6. Racimo F, Marnetto D, Huerta-Sánchez E. Signatures of Archaic Adaptive Introgression in Present-Day Human Populations. Mol Biol Evol. 2017; 34(2): 296–317. doi: 10.1093/molbev/msw216. ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5400396/
  7. Racimo F, …, Nielsen R. Archaic Adaptive Introgression in TBX15/WARS2. Mol Biol Evol. 2017; 34(3): 509–524. doi: 10.1093/molbev/msw283.
    ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5430617/
  8. Huerta-Sánchez E, …, Nielsen R. Altitude adaptation in Tibetans caused by introgression of Denisovan-like DNA. Nature. 2014; 512(7513): 194–7. doi: 10.1038/nature13408. ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4134395/
  9. Lu D, …, Xu S. Ancestral Origins and Genetic History of Tibetan Highlanders. Am J Hum Genet. 2016; 99(3): 580–594. doi: 10.1016/j.ajhg.2016.07.002. sciencedirect.com/science/article/pii/S0002929716302737?via%3Dihub
  10. Chen F, …, Hublin JJ. A late Middle Pleistocene Denisovan mandible from the Tibetan Plateau. Nature. 2019;569(7756):409–412. doi: 10.1038/s41586-019-1139-x.
  11. Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology. First hominins on the Tibetan Plateau were Denisovans. Science Daily, 01.05.2019. sciencedaily.com/releases/2019/05/190501131405.htm
  12. Mondal M, …, Bertranpetit J. Genomic analysis of Andamanese provides insights into ancient human migration into Asia and adaptation. Nat Genet. 2016; 48(9): 1066–70. doi: 10.1038/ng.3621. afanporsaber.com/wp-content/uploads/2016/08/Genomic-analysis-of-Andamanese-provides-insights-into-ancient-human.pdf
  13. Mondal M, Bertranpetit J, Lao O. Approximate Bayesian computation with deep learning supports a third archaic introgression in Asia and Oceania. Nat Commun. 2019; 10(1): 246. doi: 10.1038/s41467-018-08089-7. nature.com/articles/s41467-018-08089-7
  14. Skoglund P, …, Reich D. No evidence for unknown archaic ancestry in South Asia. Nat Genet. 2018; 50(5): 632–633. doi: 10.1038/s41588-018-0097-9. ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6433599/
  15. Hammer MF, Woerner AE, Mendez FL, Watkins JC, Wall JD. Genetic evidence for archaic admixture in Africa. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011; 108(37): 15123–8. doi: 10.1073/pnas.1109300108. pnas.org/content/108/37/15123.long
  16. Hsieh P, …, Hammer MF. Model-based analyses of whole-genome data reveal a complex evolutionary history involving archaic introgression in Central African Pygmies. Genome Res. 2016; 26(3): 291–300. doi: 10.1101/gr.196634.115. genome.cshlp.org/content/26/3/291.long

Если вы нашли ошибку, пожалуйста, выделите фрагмент текста и нажмите Ctrl+Enter.

 См. также:

  • Неравный брак28.08.2018 Неравный брак В геноме каждого европейца и азиата есть примерно 2% неандертальских фрагментов; в геномах азиатов и жителей Океании — денисовские варианты; неандертальские фрагменты есть в геноме денисовца… Но всё это были следы старых событий, случившихся за много поколений до индивидуумов, геномы которых мы изучаем. Самым близким к событию гибридизации был кроманьонец из Пештераку-Оасе в Румынии, который жил примерно 40 тыс. лет назад и был праправнуком (или, по крайней мере, прапрапраправнуком) неандертальца.
  • Эволюция человека и ее спорная вершина…08.11.2011 Эволюция человека и ее спорная вершина… За последнее десятилетие открытия в области антропогенеза сыплются как из рога изобилия. Причем происходит это сразу на двух фронтах: к традиционным палеоан-тропологическим находкам добавились достижения молодой науки — палеогенетики.
  • 25.02.2020 Добавь науку в друзья! Четвертая глобальная однодневная научно-популярная акция «Открытая лабораторная» прошла 8 февраля в День российской науки. В ней участвовали жители более чем 100 городов в России и за рубежом, свои знания проверили около 30 тыс. человек оффлайн и 90 тыс. онлайн. Охват наук весьма широк: от генетического детектива до эльфов и фей (тех, что из геофизики, а не героев фэнтези), от квазаров и радиоинтерферометров до зарождения жизни. Партнером этой рубрики выступил Российский научный фонд, который провел экспертизу всего контента акции. «Лаборанты» узнали, болели ли динозавры раком, могут ли поседеть волосы человека за одну ночь, правда ли, что причиной сахарного диабета является употребление сахара, и любые ли кошки вызывают аллергию или есть среди них […]
  • Серая мухоловка. Фото Д. Дубиковского30.07.2019 «A-C-G-T», — тарарахнул зинзивер Оказалось, что у певчих птиц (60% видов всех пернатых) в соматических клетках часть генетического материала выбрасывается! Ученые, проводившие это исследование, — Павел Бородин, профессор кафедры цитологии и генетики НГУ, гл. науч. сотр. ИЦиГ СО РАН, и его аспирантка Любовь Малиновская — рассказали о своей работе на лекции в рамках Ночи научных историй в клубе «Арт П. А.Б.» в новосибирском Академгородке.
Подписаться
Уведомление о
guest
0 Комментария(-ев)
Встроенные отзывы
Посмотреть все комментарии
Оценить: 
Звёзд: 1Звёзд: 2Звёзд: 3Звёзд: 4Звёзд: 5 (6 оценок, среднее: 5,00 из 5)
Загрузка...
 
 

Сообщить об опечатке

Текст, который будет отправлен нашим редакторам: